La Guifette noire (Chlidonias niger) est un oiseau migrateur, rare et protégée qui subit un fort déclin au niveau national. Les données anciennes connues sur sa nidification sur le marais remontent à 1907.

Elle arrive fin mars début avril pour repartir vers le mois de septembre.

Les Guifettes noires recherchent des marais à plans d’eau relativement peu profonds, pourvus d’une végétation aquatique dense et de groupements de plantes hélophytes basses (scirpaie, cariçaie…) au moins en bordure. Les nids sont installés sur les amas de végétation ou sur des petites émergences du terrain. L’eau est un élément gage de sécurité face aux prédateurs terrestres et sa présence est normalement synonyme d’abondance de nourriture.

L’intérêt patrimonial de cette espèce et son déclin, ont motivé la mise en œuvre d’une action dans le programme LIFE Nature Marais poitevin sur la période 2004 - 2008.

Une action de suivi et de protection des colonies est engagée depuis 1992 sur le Marais poitevin. Un travail de prospection des colonies débute en avril. A partir de mai, les colonies s’installent dans les dépressions humides des prairies. Sur les principales colonies, des enclos de protection (contre le piétinement du bétail) sont posé.

Depuis 15 ans, on ne dénombre plus que 1 à 3 colonies sur le marais, soit une vingtaine de couple. Par la gestion hydraulique et les pratiques des agriculteurs (assèchement des dépressions humides), la guifette ne retrouve plus son habitat pour se reproduire. De plus, les échecs de reproduction étant nombreux, on ne dénombre que très peu de jeunes à l’envol. La survie des Guifettes noires sur le Marais poitevin n’est pas assurée.